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浙江代謝組學的應用前景

來源: 發布時間:2022-09-22

非靶向代謝組學研究:對于代謝物分析,作者對非靶代謝組學測定,共檢測到4,346種代謝物。根據所有檢測到的代謝物的投影中變量重要性(VIP)>1和p<0.05的篩選標準,在不同的比較組***研究了961種差異累積代謝物(DAM)(表1)。在A果實(AF)與B果實(BF)的相同成熟階段,發現S3的DAM比S1和S2更豐富,這意味著DAM的主要變化發生在S3。隨后,利用京都基因和基因組百科全書(KEGG)富集分析進一步了解與兩個東方甜瓜品種相關的生物學機制。其中,參與蔗糖和有機酸代謝的代謝物在果實中的積累差異更大,包括“半乳糖代謝”、“磷酸戊糖途徑”、“果糖和甘露糖代謝”、“亞油酸代謝”和“花生四烯酸”。非靶向代謝組學,靶向代謝組學研究經驗。浙江代謝組學的應用前景

通過轉錄組學和代謝組學(GC-MS非靶向代謝組學)對BPF暴露和對照組的細胞進行分析,篩選到差異的基因和代謝物。分別通過富集分析,找到差異基因或代謝物參與的條目或通路。***通過差異轉錄本、代謝物和促炎細胞因子的綜合分析,揭露了它們之間的關系。本文通過多組學分析和體外模型的方式,發現了BPF暴露后腸上皮細胞轉錄組和代謝組譜的改變,揭露了BPF可能在腸道炎癥發病機制的作用。中文標題:轉錄組學結合代謝組學揭示了雙酚F(BPF)暴露對腸道炎癥的影響研究對象:人結腸粘膜上皮細胞系(NCM460)發表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:7.963發表時間:2021年11月合作單位:上海交通大學附屬新華醫院運用生物技術:GC-MS非靶向代謝組學(由鹿明生物提供技術支持)、轉錄組學、qRT-PCR江蘇代謝組學數據怎么看代謝組學生物解析 非靶代謝組學研究 靶向代謝組學研究。

非靶向代謝組學研究:利用番茄的自然變異確定番茄復合體中果實多酚的途徑結構和代謝調控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究對象:番茄組織發表期刊:MolecularPlant影響因子:13.164組學技術:LC-MS靶向代謝組學、GC-MS非靶代謝組(雙平臺代謝組學),本研究通過表征構成八種不同番茄多酚代謝網絡的潛在生物合成和修飾反應,闡明了八種番茄復合體多酚生物合成的整個生物合成框架,并對相關代謝物和結構基因進行了詳細注釋,并運用LC-MS/GC-MS雙平臺代謝組學方法為輔助育種提供幫助。此外,番茄果實成熟過程中的代謝變化為今后基于遺傳的代謝工程設計提供了研究方向,并為研究其他重要植物物種中特定的代謝物的功能提供了理論依據。

代謝組學數據提供了COVID-19患者各階段循環代謝物特征的綜合觀點,并確定了葡萄糖代謝和尿素循環的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機制。在****病程的不同階段,靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學分析中,發現隊列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰,負離子模式631個、正離子模式下的1835個;通過篩選,鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合,而重癥組和恢復組很容易區分(圖1B)。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(圖1C)。火山圖顯示了不同組代謝物與正常組相比上調下調的情況(圖1D);與正常組對比,***上調的代謝物:輕癥組有48個,嚴重組有59個,恢復組有64個;***下調的代謝物:輕癥組有33個,重癥組有29個,恢復組有34個。使用靶向代謝組學分析;首先根據發現隊列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除);定量到了199種代謝物。根據不同組的濃度,將199個代謝物分為16個簇;然后根據恢復組的代謝物是否恢復到正常水平將這些簇分為三組。空間代謝組學 代謝組學測序原理 代謝組學研究價格。

GC-MS非靶向代謝組學研究,中文標題:代謝組學分析和氧化應激反應揭示了有機磷類阻燃劑磷酸三(2-氯乙基)和磷酸三苯基對大腸桿菌的毒性研究對象:大腸桿菌發表期刊:Chemosphere影響因子:7.086作者單位:廣東石油化工大學環境科學與工程學院涉及的歐易/鹿明生物服務產品:GC-MS非靶向代謝組學(由歐易/鹿明生物提供技術支持)以往有關嘔吐***的研究多集中在免疫毒性、神經毒性、生殖毒性、遺傳毒性等方面,而關于生長發育影響的研究較少。該研究是一篇通過大腸桿菌作為研究對象利用非靶向代謝組學來探究有機磷阻燃劑影響生物的發育和功能的高質量的、創新性的的研究文章,值得學習與借鑒。代謝組學-鹿明生物-歐易生物 以生物體內所有代謝產物為研究對象。江蘇代謝組學檢測方法

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本研究通過LC-MS和GC-MS雙平臺代謝組學研究方法,對92例樣品5個時間點的尿液樣品進行分析,分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關的差異標志物,結果揭示了年輕健康人在五個不同時間點的尿液代謝譜的動態變化,采用KEGG通路富集分析和時間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關的幾種潛在代謝物生物標志物,發現短期高濃度暴露于PM可能會導致代謝改變并降低應激***水平,這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質軸的***有關;而生物氣溶膠劑則通過***系統對病理性成癮有重要作用。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標志物;4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標志物,可用于分別預測或診斷PM或生物氣溶膠相關疾病。浙江代謝組學的應用前景

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