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上海發酵液代謝組學

來源: 發布時間:2023-01-11

LC-MS靶向代謝組+16S微生物多樣性檢測研究。題目:糞便微生物可以區分酒精性肝炎引起的酒精攝入量,但不能區分疾病的嚴重程度期刊:HepatologyIF=17.425研究思路:*樣本類型:人糞便*檢測平臺:LC-MS靶向代謝組、16S微生物多樣性檢測為了表征酒精性肝炎有關的糞便微生物生態學,考察微生物組變化和疾病嚴重程度的關系,推斷微生物生態學變化的功能相關性,本文作者將中度或重度酒精性肝炎患者(MAH和SAH)的糞便微生物組與健康(HC)和重度飲酒對照組(HDC)進行比較,通過16SrRNA基因測序鑒定微生物群分類,使用LC/MS平臺測量糞便短鏈脂肪酸(SCFA)含量。重度飲酒患者與健康對照組相比、重度飲酒組與酒精性肝炎相比,均可以發現明顯的微生物組特征分布。但微生物分類不能區分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中,糞便中短鏈脂肪酸與產生SCFA的微生物菌群均減少,可以推斷出,酒精性肝炎患者的糞便微生物組有明顯的變化,與酒精性肝炎的嚴重程度無關。**話代謝、代謝組學實驗設計、數據解讀分析、數據庫介紹及使用流程。上海發酵液代謝組學

土壤代謝物可以間接反映微生物代謝過程的變化,使用基于GC-MS的非靶向代謝組學,在土壤樣品***鑒定272種代謝物并對其進行非靶向代謝組學定量,定量結果表明AgNPs暴露***改變了土壤代謝物的分布。通過參數VIP>1.5,在土壤中鑒定出20種具有重要變化的代謝物(圖3I),除少數幾個代謝物上調,大多數代謝物減少,表明AgNPs暴露通常會對土壤微生物的代謝產生負面影響。土壤代謝組學可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上應對AgNPs并作出反應,包括毒性機制和***策略。上海發酵液代謝組學代謝組學 研究一站式服務平臺。

代謝組學數據提供了COVID-19患者各階段循環代謝物特征的綜合觀點,并確定了葡萄糖代謝和尿素循環的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機制。在****病程的不同階段,靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學分析中,發現隊列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰,負離子模式631個、正離子模式下的1835個;通過篩選,鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合,而重癥組和恢復組很容易區分(圖1B)。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(圖1C)。火山圖顯示了不同組代謝物與正常組相比上調下調的情況(圖1D);與正常組對比,***上調的代謝物:輕癥組有48個,嚴重組有59個,恢復組有64個;***下調的代謝物:輕癥組有33個,重癥組有29個,恢復組有34個。使用靶向代謝組學分析;首先根據發現隊列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除);定量到了199種代謝物。根據不同組的濃度,將199個代謝物分為16個簇;然后根據恢復組的代謝物是否恢復到正常水平將這些簇分為三組。

雙平臺代謝組學研究,2022年4月,鹿明生物合作客戶中國醫學科學院醫藥生物技術研究所李亮課題組在Environmental Pollution期刊發表了題為“Potential urinary biomarkers in young adults with short-term exposure to particulate matter and bioaerosols identified using an unbiased metabolomic approach”的研究成果,通過LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究方法,發現了空氣中顆粒物和生物氣溶膠暴露有關的尿液生物標志物,并揭示了循環暴露于清潔和污染空氣環境的年輕健康人的尿液代謝特征的動態變化。鹿明生物技術支持及生信分析同事為該文章做出相應貢獻,為署名作者。代謝組學熱圖聚類分析 火山圖 散點圖如何繪制。

非靶向代謝組學研究:利用番茄的自然變異確定番茄復合體中果實多酚的途徑結構和代謝調控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究對象:番茄組織發表期刊:MolecularPlant影響因子:13.164組學技術:LC-MS靶向代謝組學、GC-MS非靶代謝組(雙平臺代謝組學),本研究通過表征構成八種不同番茄多酚代謝網絡的潛在生物合成和修飾反應,闡明了八種番茄復合體多酚生物合成的整個生物合成框架,并對相關代謝物和結構基因進行了詳細注釋,并運用LC-MS/GC-MS雙平臺代謝組學方法為輔助育種提供幫助。此外,番茄果實成熟過程中的代謝變化為今后基于遺傳的代謝工程設計提供了研究方向,并為研究其他重要植物物種中特定的代謝物的功能提供了理論依據。代謝組學、空間代謝組學多組學聯合分析服務。北京代謝組學測樣

代謝組學研究技術與應用、代謝組學數據庫。上海發酵液代謝組學

GC-MS非靶向代謝組學等研究方法:2021年10月,廣東石油化工大學環境科學與工程學院孫建騰教授課題組在《Chemosphere》期刊發表的題為“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通過GC-MS非靶向代謝組學等研究方法,發現包括糖酵解/糖異生、磷酸戊糖代謝、嘌呤代謝、谷胱甘肽代謝、胺素代謝,丙氨酸和天冬氨酸等代謝途徑被破壞。大多數差異表達的代謝物被下調,表明有機磷阻燃劑對代謝功能和關鍵代謝途徑有抑制作用。本研究揭示了生物中有機磷阻燃劑對環境產生的風險提供了新的見解。上海發酵液代謝組學

上海歐易生物醫學科技有限公司正式組建于2009-03-10,將通過提供以科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢等服務于于一體的組合服務。業務涵蓋了科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢等諸多領域,尤其科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢中具有強勁優勢,完成了一大批具特色和時代特征的醫藥健康項目;同時在設計原創、科技創新、標準規范等方面推動行業發展。我們在發展業務的同時,進一步推動了品牌價值完善。隨著業務能力的增長,以及品牌價值的提升,也逐漸形成醫藥健康綜合一體化能力。歐易生物始終保持在醫藥健康領域優先的前提下,不斷優化業務結構。在科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢等領域承攬了一大批高精尖項目,積極為更多醫藥健康企業提供服務。

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