4D蛋白組學：tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度（TIMS）和同步累積連續碎裂（PASEF）數據采集模式兩大創新技術，可實現快速采集、更高的靈敏度和特異性。同時，其配備了***一代雙 TIMS 分析器，離子容量可提高三倍，比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度，讓蛋白質組學分析再上一個新的臺階，鹿明生物同時配備了Evosep One高通量色譜使其在短梯度下也能實現蛋白深度覆蓋，結果更精細，也成為轉化組學應用不可或缺的工具。更高掃描速度：助力臨床大隊列項目研究，更高覆蓋深度：助力蛋白組鑒定到更多的蛋白數量，超高靈敏度：助力微量樣本蛋白組分析，鑒定更可信：助力蛋白或化合物更高可信度的鑒定。蛋白質組學基本策略 研究基礎 研究內容 研究意義背景。江蘇蛋白組學 武漢

蛋白質組數據分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質（ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK）。此外，AC顯示出抑制脂肪生成酶（ACC，FASN和SCD1）表達的趨勢，同時***上調了GLUT2。與對照組相比，AC***增加了PEPCK的表達，兩種化學物質對G6Pase均無***影響（圖4A）。PRM蛋白靶向驗證測定結果與蛋白質組變化相一致，這進一步證實了蛋白質組學數據中蛋白質的表達（圖4B）。轉錄組學和蛋白質組學聯合分析結果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示，處理組的氧化磷酸化（OXPHOS）通路***上調，AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。遼寧tmt蛋白組學定性質譜技術,生物信息學方法,提供蛋白質組學 。

2022年2月，亞特蘭大埃默里大學醫學院的Erik C. B. Johnson課題組在Nature neuroscience發表了題為 “Large-scale deep multi-layer analysis of Alzheimer’s disease brain reveals strong proteomic disease-related changes not observed at the RNA level”的研究成果，通過基因組學、轉錄組學、TMT標記定量蛋白質組學、代謝組學的研究方法，揭示了新的與AD相關的蛋白共表達模塊，部分模塊在RNA的網絡中不存在。這為開發疾病***的潛在靶點提供依據，為臨床的蛋白質組研究提供重要價值。

3篇經典的蛋白組學和代謝組學在水產動物中的研究。水產動物的研究不僅是保障我國海水養殖業的健康可持續發展，同時可為良種創制、海洋環境研究、生態研究等提供重要理論基礎和技術支撐~因此在水產生物研究方面蛋白組學、代謝組學在其中起到什么作用呢？期望這3篇經典文章能給您思路~中文標題：CO2誘導的海洋酸化損害了太平洋牡蠣對金氏弧菌的免疫功能:細胞和蛋白質組學的綜合研究研究對象：牡蠣發表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影響因子：6.551合作單位：中國科學院海岸帶研究所運用歐易/鹿明生物技術：iTRAQ標記定量蛋白質組學（由鹿明生物提供技術支持）蛋白組學專業客服在線為您答疑 。

TMT標記定量蛋白質組學研究案例：2021年12月威爾康奈爾醫學中心和紀念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果，通過蛋白質組學和代謝組學研究方法，發現了高度轉移性 SOX2/OCT4+ 細胞的離散亞群表現出細胞內銅水平升高特征，探究了TM 介導的復合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細胞群中的主要代謝缺陷，AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉移軸，為高風險三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據。中文標題：銅耗竭調節線粒體氧化磷酸化以損害三陰性乳腺*轉移研究對象：高風險三陰性乳腺*(TNBC)發表期刊：NatureCommunications影響因子：14.919發表時間：2021年12月合作單位：紀念斯隆凱特琳**中心，Sandra和EdwardMeyer**中心運用關鍵生物技術：TMT標記定量蛋白質組學和靶向代謝組學蛋白組學，研究方法，高通量定性定量研究,有。遼寧磷蛋白組學

定量蛋白質組學 蛋白質進行質譜檢測未知蛋白進行全檢測。江蘇蛋白組學 武漢

本研究采用串聯質量標簽（TMT）標記的蛋白質組學和平行反應監測（PRM）技術，對蓮子脫水過程中的生理調控網絡進行了深入研究表明，碳水化合物代謝（包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織）、ER中的蛋白質加工、DNA修復和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應。在蓮種胚脫水過程中，非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑，在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結果為揭示荷花胚胎脫水保護機制的生理學調控網絡提供了酶途徑在抗氧化保護中起著主要作用。應激生理學檢測表明，H2O2是誘發氧化應激損傷的主要活性氧（ROS）成分，谷胱甘肽新的見解。江蘇蛋白組學 武漢

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