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江蘇人類代謝組學數據庫

來源: 發布時間:2022-09-06

非靶向代謝組學研究:對于代謝物分析,作者對非靶代謝組學測定,共檢測到4,346種代謝物。根據所有檢測到的代謝物的投影中變量重要性(VIP)>1和p<0.05的篩選標準,在不同的比較組***研究了961種差異累積代謝物(DAM)(表1)。在A果實(AF)與B果實(BF)的相同成熟階段,發現S3的DAM比S1和S2更豐富,這意味著DAM的主要變化發生在S3。隨后,利用京都基因和基因組百科全書(KEGG)富集分析進一步了解與兩個東方甜瓜品種相關的生物學機制。其中,參與蔗糖和有機酸代謝的代謝物在果實中的積累差異更大,包括“半乳糖代謝”、“磷酸戊糖途徑”、“果糖和甘露糖代謝”、“亞油酸代謝”和“花生四烯酸”。代謝組學、空間代謝組學多組學聯合分析服務。江蘇人類代謝組學數據庫

GC-MS非靶向代謝組學研究,2022年2月,上海市農業科學院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《Frontiers in Microbiology》期刊發表的題為“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果,通過iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學等技術對香菇菌絲進行定量蛋白質組學和代謝組學分析,發現氧化應激和自噬是香菇菌絲后熟轉色重要過程,并對其在蛋白質組和代謝組水平上的分子機制有了新的認識。中文標題:氧化應激和自噬是香菇菌絲后熟轉色形成的重要過程發表期刊:FrontiersinMicrobiology影響因子:5.64作者單位:上海市農業科學院食用菌研究所涉及的歐易/鹿明生物服務產品:iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學。上海血清代謝組學代謝組學專區 系統生物學驅動的功能代謝組學方法,具有高靈敏、高分辨和高通量。

LC-MS靶向代謝組+16S微生物多樣性檢測研究。題目:糞便微生物可以區分酒精性肝炎引起的酒精攝入量,但不能區分疾病的嚴重程度期刊:HepatologyIF=17.425研究思路:*樣本類型:人糞便*檢測平臺:LC-MS靶向代謝組、16S微生物多樣性檢測為了表征酒精性肝炎有關的糞便微生物生態學,考察微生物組變化和疾病嚴重程度的關系,推斷微生物生態學變化的功能相關性,本文作者將中度或重度酒精性肝炎患者(MAH和SAH)的糞便微生物組與健康(HC)和重度飲酒對照組(HDC)進行比較,通過16SrRNA基因測序鑒定微生物群分類,使用LC/MS平臺測量糞便短鏈脂肪酸(SCFA)含量。重度飲酒患者與健康對照組相比、重度飲酒組與酒精性肝炎相比,均可以發現明顯的微生物組特征分布。但微生物分類不能區分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中,糞便中短鏈脂肪酸與產生SCFA的微生物菌群均減少,可以推斷出,酒精性肝炎患者的糞便微生物組有明顯的變化,與酒精性肝炎的嚴重程度無關。

本研究通過LC-MS和GC-MS雙平臺代謝組學研究方法,對92例樣品5個時間點的尿液樣品進行分析,分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關的差異標志物,結果揭示了年輕健康人在五個不同時間點的尿液代謝譜的動態變化,采用KEGG通路富集分析和時間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關的幾種潛在代謝物生物標志物,發現短期高濃度暴露于PM可能會導致代謝改變并降低應激***水平,這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質軸的***有關;而生物氣溶膠劑則通過***系統對病理性成癮有重要作用。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標志物;4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標志物,可用于分別預測或診斷PM或生物氣溶膠相關疾病。代謝組學 生物標志物挖掘**-歐易生物。

非靶向和靶向代謝組學研究方法,2021年7月,廣州多家研究機構科研人員在EuropeanRespiratoryJournal期刊發表了題為“Metabolomicanalysesrevealsnewstage-specificfeaturesoftheCOVID-19”的研究成果,該研究以****患者為研究對象,運用非靶向和靶向代謝組學研究方法,提供了****患者所有階段循環代謝物特征的綜合視圖,并確定糖代謝和尿素循環的代謝重新編程是****的潛在病理機制;提出以宿主代謝為靶點可能是在病程不同階段對抗****的一種可行的方法。代謝組學-歐易生物/鹿明生物 客戶好評 專注代謝組學研究。北京代謝組學ppt

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GC-MS非靶向代謝組學研究,中文標題:代謝組學分析和氧化應激反應揭示了有機磷類阻燃劑磷酸三(2-氯乙基)和磷酸三苯基對大腸桿菌的毒性研究對象:大腸桿菌發表期刊:Chemosphere影響因子:7.086作者單位:廣東石油化工大學環境科學與工程學院涉及的歐易/鹿明生物服務產品:GC-MS非靶向代謝組學(由歐易/鹿明生物提供技術支持)以往有關嘔吐***的研究多集中在免疫毒性、神經毒性、生殖毒性、遺傳毒性等方面,而關于生長發育影響的研究較少。該研究是一篇通過大腸桿菌作為研究對象利用非靶向代謝組學來探究有機磷阻燃劑影響生物的發育和功能的高質量的、創新性的的研究文章,值得學習與借鑒。江蘇人類代謝組學數據庫

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