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江蘇根系微生物液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)

來源: 發(fā)布時間:2025-11-04

液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)以液滴微流控技術(shù)為關(guān)鍵支撐,通過精密微通道設(shè)計實現(xiàn)微生物或細胞的單顆粒封裝與精確操控,其關(guān)鍵結(jié)構(gòu)包含液滴生成、操控、培養(yǎng)與分析四大模塊。在液滴生成環(huán)節(jié),系統(tǒng)可通過微流控芯片以高達 20000 Hz 的頻率生成體積均一的皮升 / 微升級液滴,將單個微生物或細胞與培養(yǎng)基共同包裹其中,形成完全隔離的單獨培養(yǎng)微環(huán)境。培養(yǎng)模塊采用高透氣性聚合物管路作為容器,可提供可控氧分壓環(huán)境并支持長達 60 天的長時間孵育,同時避免瓊脂凝固產(chǎn)生的過氧化氫等抑制性物質(zhì)影響。檢測分析模塊則集成 OD600、多波段熒光及化學(xué)發(fā)光檢測功能,配合分選單元實現(xiàn)目標(biāo)液滴的精確篩選與收集,構(gòu)成 "生成 - 培養(yǎng) - 檢測 - 分選" 的完整技術(shù)閉環(huán)。


在植物學(xué)中,該技術(shù)可用于分離和培養(yǎng)原生質(zhì)體,研究植物細胞全能性。江蘇根系微生物液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)

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    在代謝產(chǎn)物發(fā)現(xiàn)與作用機制研究這一傳統(tǒng)領(lǐng)域,液滴培養(yǎng)組學(xué)帶來了顛覆性的創(chuàng)新思路。面對病原微生物耐藥性日益嚴峻的全球挑戰(zhàn),從復(fù)雜環(huán)境樣本或合成化合物庫中快速篩選新型代謝產(chǎn)物變得至關(guān)重要。液滴系統(tǒng)通過將單個環(huán)境微生物(如土壤細菌)與報告病原菌共同包裹在微滴中,構(gòu)建了海量的“生產(chǎn)者-指示者”對。在共培養(yǎng)過程中,如果生產(chǎn)者菌株能夠分泌抑制或殺死報告病原菌的活性物質(zhì),其所在的微滴便會通過報告菌的熒光減弱或形態(tài)變化等讀出信號被識別。隨后,這些“命中”的液滴可以被分選出來,用于活性化合物的分離與鑒定。這種基于共培養(yǎng)的策略,不僅顯著提高了篩選通量、降低了試劑消耗,更重要的是它能夠直接挖掘微生物之間在自然狀態(tài)下存在的拮抗相互作用,更容易發(fā)現(xiàn)具有新穎結(jié)構(gòu)或作用機制的活性先導(dǎo)化合物。此外,該系統(tǒng)同樣適用于研究代謝產(chǎn)物對病原菌的作用機理:將藥物與單個細菌包裹,通過長時間活細胞成像,可以在單細胞水平精確觀察藥物誘導(dǎo)的形態(tài)變化、生長抑制或殺滅動力學(xué),揭示異質(zhì)性的耐藥應(yīng)答,為理解耐藥性產(chǎn)生機制和開發(fā)聯(lián)合用藥策略提供寶貴的動態(tài)數(shù)據(jù)。 山東 全自動液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)哪家好液滴培養(yǎng)組學(xué)是連接單細胞基因組學(xué)與微生物組功能研究的重要橋梁技術(shù)。

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對于組織樣本等具有復(fù)雜空間結(jié)構(gòu)的生物學(xué)材料,液滴培養(yǎng)組學(xué)技術(shù)可以輔助進行空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的樣本預(yù)處理與條形碼標(biāo)記。通過將組織消化后獲得的單細胞或細胞核懸液與帶有對應(yīng)空間位置編碼序列的微珠共同封裝在液滴中,在液滴內(nèi)完成mRNA的捕獲并被打上位置標(biāo)簽,從而在后續(xù)的單細胞測序中保留細胞原始的空間位置信息。雖然這只是液滴技術(shù)作為分子生物學(xué)工具的一個應(yīng)用側(cè)面,但它深刻體現(xiàn)了該技術(shù)在整合細胞表型與空間位置等多維度信息方面的靈活性與強大潛力。

    土壤環(huán)境中蘊藏著極為豐富的微生物資源,其多樣性遠超其他生境,是環(huán)境資源挖掘的主要目標(biāo)。液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)為解鎖這一“黑色寶箱”提供了工具。傳統(tǒng)培養(yǎng)方法難以模擬土壤微環(huán)境的復(fù)雜性,導(dǎo)致絕大多數(shù)土壤微生物處于“微生物暗物質(zhì)”狀態(tài)。而液滴微流控技術(shù)能夠?qū)蝹€土壤微生物細胞與微升級別的、成分可控的培養(yǎng)介質(zhì)共同包裹在皮升至納升尺度的液滴中,形成數(shù)以百萬計的超高通量培養(yǎng)單元。這些單元在物理上是隔離的,但通過調(diào)控液滴內(nèi)的微環(huán)境,可以高度模擬土壤顆粒孔隙中的原生條件,例如特定的水分活度、氧氣梯度、pH波動以及營養(yǎng)濃度。研究人員可以設(shè)計包含不同碳源、氮源、微量元素甚至植物根系分泌物的培養(yǎng)基組合,來靶向性地復(fù)蘇那些具有特定代謝功能的稀有物種。例如,針對難降解有機物(如多環(huán)芳烴)的降解菌,可以在液滴中添加該物質(zhì)作為碳源,只有能夠利用它的微生物才會生長繁殖,進而通過熒光液滴分選技術(shù)將其高效分離。這種基于液滴的微型化培養(yǎng),不僅極大地降低了試劑消耗,更重要的是通過創(chuàng)造海量的、多樣化的微生境,突破了微生物生長的“瓶頸”,使得過去那些在標(biāo)準(zhǔn)實驗室條件下無法生長的土壤微生物得以復(fù)蘇和擴增。 基于液滴的微培養(yǎng)技術(shù)正推動微生物學(xué)、免疫學(xué)和藥物發(fā)現(xiàn)等領(lǐng)域的創(chuàng)新。

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微生物代謝工程領(lǐng)域因液滴培養(yǎng)篩選系統(tǒng)的應(yīng)用而加速發(fā)展。傳統(tǒng)代謝工程中,評估工程菌株的性能通常需要經(jīng)過繁冗的搖瓶培養(yǎng)或微孔板檢測,通量有限且成本高昂。液滴微流控技術(shù)能夠?qū)蝹€工程菌株封裝在液滴中,并添加特定的底物或指示劑,通過監(jiān)測液滴內(nèi)代謝產(chǎn)物的積累或熒光信號的變化,快速評估數(shù)千個工程菌株的生產(chǎn)性能。例如,在生物燃料生產(chǎn)中,可以基于液滴內(nèi)脂質(zhì)積累量進行高通量篩選;在酶制劑開發(fā)中,可通過熒光底物檢測酶活性。更重要的是,液滴系統(tǒng)允許實施多輪遞進式篩選策略,通過多參數(shù)排序和液滴融合等技術(shù),逐步富集性能優(yōu)異的突變體。這種基于液滴的篩選策略不僅大幅提高了篩選通量,降低了試劑消耗,還能夠檢測到傳統(tǒng)方法可能遺漏的稀有高性能變種,加速了細胞工廠的構(gòu)建進程。通過時間分辨的液滴分析,可以繪制出單細胞水平的基因表達動態(tài)圖譜。江蘇根系微生物液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)

該系統(tǒng)利用微流控技術(shù)生成數(shù)萬個納升尺度的液滴,作為單獨的微型生物反應(yīng)器。江蘇根系微生物液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)

    基于液滴的數(shù)字PCR與定量培養(yǎng)技術(shù)相結(jié)合,為微生物學(xué)提供了定量的強大工具。在微生物生態(tài)學(xué)、環(huán)境監(jiān)測和臨床診斷中,精確測定樣品中特定微生物的活菌濃度至關(guān)重要。傳統(tǒng)的菌落形成單位計數(shù)法不僅耗時長達數(shù)天,且精度有限,尤其對于生長緩慢或需求苛刻的微生物。液滴培養(yǎng)系統(tǒng)將樣品進行系列稀釋后,與營養(yǎng)培養(yǎng)基混合并生成大量微滴。根據(jù)泊松分布原理,經(jīng)過適當(dāng)稀釋,大部分液滴中不含任何細胞,少部分液滴含有一個細胞,極少數(shù)含有多個細胞。將整個液滴陣列在適宜條件下培養(yǎng)后,通過統(tǒng)計出現(xiàn)生長的液滴比例,即可反向計算出原始樣品中的活菌濃度。這種方法被稱為微滴數(shù)字培養(yǎng),其靈敏度極高,甚至能夠檢測出樣品中極其稀有的目標(biāo)微生物。更重要的是,該系統(tǒng)可以與熒光探針相結(jié)合,在培養(yǎng)結(jié)束后對液滴進行基于數(shù)字PCR原理的檢測:對每個液滴進行終點熒光信號讀取,只有那些含有目標(biāo)微生物且其增殖達到一定程度的液滴才會被判定為“陽性”。這種將生長表型與特異性核酸檢測相結(jié)合的“表型-PCR”雙確認模式,極大地提高了定量的準(zhǔn)確性和特異性,特別適用于在復(fù)雜背景菌群中量化某一特定病原菌或功能菌株的豐度。 江蘇根系微生物液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)

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