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上海疾病模型科研技術服務實驗

來源: 發布時間:2025-09-11

m6A修飾圖譜構建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構建疾病細胞模型或者發病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數量及分布,Peak關聯基因的特征,聯合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質瘤增殖相關的FOXM1,通過qPCR、WB、免疫熒光、核質分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調節FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調節,作者研究了FOXM1的鄰近基因,發現lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達、共定位,進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發生。傳統的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質重構。近。裸鼠皮下成瘤模型造模意義.上海疾病模型科研技術服務實驗

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制作該模型的方法為大鼠腹腔麻醉消毒后選取腹部正中切口打開腹腔長約2cm,尋找盲腸,小心分離其遠端與大腸的系膜,在盲腸遠端1/2處用無菌4號絲線緊緊結扎,并用無菌7號針頭在已結扎盲腸遠端處貫通穿刺,然后把盲腸推回腹腔,關閉腹腔。影響因素多數研究一致認為盲腸結扎位置是CLP模型中死亡率和疾病嚴重程度的主要決定因素。結論為:①結扎25%或以下的盲腸死亡率幾乎為零,為輕度膿毒癥;②結扎50%~60%的盲腸導致術后死亡率為60%,為中度膿毒癥;③結扎75%或以上的盲腸導致小鼠在術后2~3d內全部死亡,為重度膿毒癥。而在不同程度膿毒癥中,死亡主要集中在初的48h內。有研究通過改變盲腸結扎位置和穿刺針直徑來調節膿毒癥的嚴重程度,其中提到與結扎長度小于1cm的小鼠相比,結扎長度超過1cm的小鼠死亡率增加至100%;增加穿刺針的直徑也使得存活率從100%(22G針)降低至55%(19G針)。結論為:在上述兩個因素中,盲腸結扎位置比針頭大小影響更為。CLP誘導的膿毒癥術后6h即可出現菌血癥,術后約12h出現膿毒癥相關臨床癥狀,包括發熱、寒戰、毛發豎立、全身無力和活動減少等,術后18h開始死亡。總之,在制作CLP模型時。海南疾病科研技術服務外包總的來說,動物疾病模型是一種重要的研究工具,可以幫助科學家們更好地了解疾病的發生機制和開發新方法.

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采用opti-MEM和Lipo3000分別轉染含有目的基因的pMSCV-eGFP、VSV、GAG質粒及對照載體,每皿加入脂質體-質粒轉染混懸液按購買脂質體相關說明書操作定量。繼續培養24h。2)24小時后,將培養基更換為新鮮的DMEM完全培養基,放進細胞培養箱繼續培養48~72h。3)48~72h后收集上層培養液,并過μm濾膜,采用ELISA法對所獲得的慢載體進行滴度測定。如不及時使用可以凍存于-80℃。3、慢轉染1)轉染前1天將細胞接種6孔培養板,時細胞的融合率約為50%,前需換液,加入1mLDMEM完全培養基。2)冰浴融化后加入相應體積的液及聚凝胺(Polybrene),混勻后放入37℃孵箱中繼續培養3)4h后補充1mL培養基,14h后換液(24h內換液即可)。4)72h后用倒置顯微鏡觀察熒光,監測效率,出現較多熒光時將等量的轉染細胞和未轉染細胞分別加入等濃度Puromycin(Puromycin或其他篩選濃度需要事先摸索)。5)待未轉染細胞全部死亡并且可觀察到滿意熒光量時,降低Puromycin濃度培養。也可以挑去單克隆細胞株進行進一步培養,以得到滿意的穩定表達目的基因的細胞株。6)使用qRT-PCR和Westernblot的方法檢測目的基因的表達量和蛋白水平是否顯著提高。7)由此可得三組細胞株:a.正常細胞株;b.空載載體的細胞株。

保存于嚴密緊塞或加蓋的容器里,同時在容器外上標簽,并隨同材料在溶液中投入相應的標簽,以免相互混淆。標簽上注明固定液、材料來源、日期等。標簽上的文字,應用黑色鉛筆或繪圖黑墨水書寫。3.脫水注意事項(1)脫水原理:乙醇與石蠟不相溶,而二甲苯既能溶于乙醇又能溶于石蠟。當組織中全部被二甲苯占有時,光線可以透過,組織呈現出不同程度的透明狀態。(2)脫水必須在有蓋的玻璃品中進行,防止吸收空氣中的水分。(3)在更換高一級的脫水劑時,不要移動材料以免損壞,可用吸管吸出器皿中的脫水劑,再用吸水吸盡器皿內剩余液,然后于皿中加入高一級脫水劑。(4)在低濃度酒精中,每級停留不宜太長,否則易使組織變軟,助長材料的解體。(5)在高濃度或純酒精中,每級停留的時間也不宜太長,否則會使組織變脆,影響切片。(6)如需過夜,應停留在70%酒精中。(7)脫水必須徹底,否則不易透明,甚至使透明劑內出現白色混濁現象。4.透明注意事項(1)使用透明劑時,要隨時蓋緊蓋子,以免空氣中的水分進入。(2)更換每級透明劑,動作要迅速,一方面為了不使材料塊干涸,另一方面能避免吸收濕氣。(3)在透明過程中,如果材料周圍出現白色霧狀,說明材料中的水未被脫凈。進行免疫沉淀法時,抗體需要和一個受質結合。

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轉錄組測序結果及TCGA數據庫分析)圖5RNA-Seq和m6A-seq聯合鑒定SOCS2是介導的m6A修飾的下游靶基因PLoSOne2015,在許多不同種類的RNA中,都已觀察到N6-腺苷(m6A)的甲基化,但其在microRNAs中還沒有被研究。研究者在FTO1C1,FTO2D4和FTO3C3細胞系中,通過敲除m6A甲基轉移酶FTO篩選到表達差異的microRNA,說明miRNA受m6A甲基化的調控。進一步通過MeRIP-Seq發現相當一部分的microRNA具有m6A修飾。通過motif分析,他們發現了區分甲基化和非甲基化microRNA的一致序列。該文章所述的表觀遺傳修飾在基因表達的轉錄調控的復雜性上增加了一個新的層次。圖FTO敲除對甲基化的miRNAs的穩定狀態的影響。參考文獻Y,DominissiniD,RechaviG,HeC:Geneexpressionregulationmediatedthroughreversiblem(6)(5):(1):(12):(6):(1):(1):(uridine)(41):(6)(7540):(1):(7481):(4):(6)A-LAIC-seqrevealsthecensusandcomplexityofthem(6)(8):UTRm(6)(4):(7544):(6)(6):(5):(7667):(2):"">panstyle="color:#f5c81c;">xiainducesthebreastcancerstemcellphenotypebyHIF-dependentandALKBH5-mediatedm(6)(14):"">panstyle="color:#f5c81c;">(40):(6)(3):(1):(1):(4):(11):。科研技術服務的具體服務內容相當豐富,涵蓋了多個方面。江蘇病理科研技術服務實驗

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原理HE染色主要使用蘇木精和伊紅這兩種染液,其中蘇木精堿性染液為藍色,可以將組織的酸性結構染成藍紫色(細胞核呈現藍色;軟骨基質、鈣鹽顆粒呈深藍;粘液呈灰藍);伊紅是一種化學合成的酸性染料,在水中解離成帶負電荷的陰離子,易于蛋白質氨基中的正電荷結合使細胞漿染色。細胞漿、肌肉、結締組織、嗜伊紅顆粒等被染成不同程度的紅色或粉紅色。材料與儀器小鼠、固定液、酒精、二甲苯、石蠟、蜂蠟蘇木精染液、伊紅酒精溶液、鹽酸酒精溶液甘油蛋白粘片劑、中性樹膠石蠟包埋機、切片機、恒溫箱、蠟杯酒精燈、解剖剪、培養皿、鑷子、單面刀片染色缸、蓋玻片、載玻片、玻片盤、顯微鏡溫度計、水浴鍋步驟一、制作卵巢石蠟切片1、取材小鼠腹腔注射戊巴比妥鈉(50mg/kg)進行麻醉,頸椎脫臼法處死小鼠,取出雙側卵巢。取下所需組織,切成一小塊3~4mm厚。2、固定、洗滌、脫水(1)將切好的卵巢組織用生理鹽水洗一下,使用中性福爾馬林固定液固定30~50min。后用流水沖洗3次,每次5min。(2)卵巢組織依次經70%、80%、90%乙醇溶液脫水,各30min。(3)再放入95%、100%乙醇溶液各2次,每次20min。3、透明、透蠟(1)使用純酒精、二甲苯等量混合液處理組織15min。上海疾病模型科研技術服務實驗

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